前国民党高级将领史伯言走下飞机的舷梯，终于在几十年后回到了祖国大陆探亲。在女儿女婿的陪同下，他要在南京寻找自己的母亲。无意之中，史伯言与一位中国人民解放军的现役老军人邂逅，原来他正是史伯言同村同族的兄弟史海良。他们一起长大、参军、打日本鬼子，也曾在解放战争里多次交手。史伯言心绪万千，没有勇气去认史海良。后来，史伯言终于找到了自己的母亲，原来几十年来，一直是史海良在照顾他的母亲。在中秋之夜，大家终于相认了，两个亲密地走到一起。

《秋水长天》是导演黄以功上世纪80年代初期的荧屏作品，曾在播出当年荣获中国台湾电视“金钟奖”，并奠定了此剧领衔主演者萧芳芳、刘德凯中国台湾电视文艺片领军人物的地位。20年后，黄以功重拍中国台湾视坛编剧高手夏美华的这部经典作品，特地将故事的发生地挪到了充满生机与活力的国际大都市上海，因而邀请土生土长的上影青年女编剧、曾以话剧《女人话题》荣膺田汉戏剧文学奖二等奖的王帆执笔改编。新版《秋水长天》仍保留了婉转、凄美的剧情风格和沧海桑田、至死不渝的爱情主题，但视野更加开阔，以传统与现代交替之际的宏大背景，表现了当代

黑社会大佬（吕良伟饰）跑路之前将自己刚出世的婴孩托付给契夫唐秋水（吴孟达饰），起名为唐十二（刘德华饰），从此人们都称他做十二少，因为他有十二个黑白两道的契父契妈，表面上他上天之骄子，但内心比谁都寂寞。养大他的契父唐秋水是庙街的百搭替工，还有一个可能是亲母的龟婆叫凤凰女（叶德娴饰），她是全庙街最麻烦的女人，当年同月同日舍弃了自己的儿子在庙街。他有一个世仇叫立令，是官涌的霸王，他比魔鬼还可怕。一天，十二少遇见一个来庙街传道的女子叫德兰（王祖贤饰），由第一眼开始，他便爱上她……